Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M10.4Q85ZW8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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