Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cracr2bQ80ZJ8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms