Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc27Q80YS5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms