Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80Y73 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80Y73 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80Y73 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q80Y73 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q80Y73 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q80Y73 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q80Y73 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80Y73 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80Y73 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80Y73 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80Y73 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80Y73 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80Y73 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80Y73 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80Y73 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80Y73 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80Y73 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80Y73 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q80Y73 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms