Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms