Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tnfsf18Q7TS55 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms