Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp397Q7TNK4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms