Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Trappc6aQ78XR0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trappc6aQ78XR0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trappc6aQ78XR0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trappc6aQ78XR0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trappc6aQ78XR0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trappc6aQ78XR0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trappc6aQ78XR0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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