Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms