Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Mindy1Q76LS9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Mindy1Q76LS9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Mindy1Q76LS9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Mindy1Q76LS9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Mindy1Q76LS9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Mindy1Q76LS9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Mindy1Q76LS9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Mindy1Q76LS9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Mindy1Q76LS9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mindy1Q76LS9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mindy1Q76LS9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mindy1Q76LS9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mindy1Q76LS9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mindy1Q76LS9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mindy1Q76LS9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mindy1Q76LS9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mindy1Q76LS9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mindy1Q76LS9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mindy1Q76LS9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mindy1Q76LS9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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