Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb10Q6XAR7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms