Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms