Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tmeff1Q6PFE7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tmeff1Q6PFE7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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