Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms