Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak1Q6PD31 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak1Q6PD31 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms