Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Soga3Q6NZL0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms