Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sv2cQ69ZS6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sv2cQ69ZS6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sv2cQ69ZS6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sv2cQ69ZS6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sv2cQ69ZS6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms