Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp9bQ66X22 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms