Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Top2bQ64511 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Top2bQ64511 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms