Protein–RNA interactions for Protein: Q64163

Tfdp2, Transcription factor Dp-2, mousemouse

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp2Q64163 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tfdp2Q64163 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfdp2Q64163 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms