Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vil1Q62468 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vil1Q62468 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms