Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20865Q62460 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20865Q62460 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20865Q62460 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm20865Q62460 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm20865Q62460 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm20865Q62460 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20865Q62460 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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