Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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