Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms