Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

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Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rai1Q61818 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rai1Q61818 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rai1Q61818 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rai1Q61818 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rai1Q61818 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rai1Q61818 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rai1Q61818 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rai1Q61818 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rai1Q61818 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rai1Q61818 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms