Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcd1Q61466 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcd1Q61466 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms