Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lamb3Q61087 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms