Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms