Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a4Q60857 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Slc6a4Q60857 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Slc6a4Q60857 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Slc6a4Q60857 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Slc6a4Q60857 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Slc6a4Q60857 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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