Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm1Q60636 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms