Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brip1Q5SXJ3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms