Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms