Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms