Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms