Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms