Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syce1lQ5D525 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms