Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms