Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syne3Q4FZC9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syne3Q4FZC9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syne3Q4FZC9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syne3Q4FZC9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syne3Q4FZC9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syne3Q4FZC9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms