Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Snx25Q3ZT31 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Snx25Q3ZT31 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Snx25Q3ZT31 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Snx25Q3ZT31 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Snx25Q3ZT31 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Snx25Q3ZT31 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx25Q3ZT31 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx25Q3ZT31 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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