Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1D3

Ampd1, AMP deaminase 1, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd1Q3V1D3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ampd1Q3V1D3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ampd1Q3V1D3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms