Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim80Q3V061 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim80Q3V061 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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