Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Prdm6Q3UZD5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm6Q3UZD5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms