Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Pfdn4Q3UWL8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pfdn4Q3UWL8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Pfdn4Q3UWL8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pfdn4Q3UWL8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pfdn4Q3UWL8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn4Q3UWL8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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