Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms