Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxosQ3UL53 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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