Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx27Q3UHD6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms