Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nom1Q3UFM5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nom1Q3UFM5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms