Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms