Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssbp4Q3U4B1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms