Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd33bQ3U0L2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd33bQ3U0L2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms